デューテリウムはデューテリウムシンセサイザーのみによって生産される資源です。二重水素です。デューテリウムはリサーチのコストや一部の建造物の建設やアップグレード、それに一部の船の建造コストのコストとして要求されています。そして、艦隊を稼働させる際に消費するの燃料としても必要になってきます。銀河ビューで現在選択しているコロニーの属さない太陽系を選択するのにも必要です（10デューテリウム）。また、月にのみ建設できる建造物の一つである大型センサー群が建設済みの場合、5,000デューテリウムを消費することで稼働させることが出来ます。